Pizza Kraków to bez wątpienia bardzo smaczne danie, które możemy niskim kosztem i w krótkim czasie przygotować w domu. Od wielu lat jednak, pizza budzi także różnego rodzaju kontrowersje, związane z ich sposobem przygotowania, używanymi składnikami, czy też sprzeczką dotyczącą tego co tak naprawdę powinniśmy nazywać pizzą. Poczynając od sposobów przygotowania, istnieje grupa zwolenników, którzy twierdzą, że prawdziwa pizza Kraków powinna być przygotowana tylko i wyłącznie w piecu kamiennym, tak jak przygotowywane są oryginalne pizze włoskie. Prawdziwi włoscy restauratorzy zajmujący się od wielu lat przygotowaniem pizzy uważają, że pizza przygotowana w piecu gazowym, czy też elektrycznym to swego rodzaju "herezja" i nie powinno się prowadzić takich praktyk. Innym problemem dotyczącym pizzy jest ich skład - lekarze przestrzegają, że pizze zawierają dużo soli, tłuszczy i kalorii, co negatywnie wpływa na nasze zdrowie. Pizze z najpopularniejszych sieci restauracji zawierają nawet dwukrotną dzienną dawkę soli, co z całą pewnością nie jest dla nas zdrowe. Kolejną kontrowersją dotyczącą pizzy jest fakt, że restauratorzy z Włoch żądają opatentowania pizzy i zabraniają nazywania pizzą dań przygotowywanych na grubszych ciastach - ich zdaniem, prawdziwa pizza Kraków to ta wykonana na cienkim cieście.